第4集

　　汪美麟得知祁钰被关担心不已，而曹吉祥在永庆庵没有接应到祁钰。徐侍郎上门与杭纲商议两家的亲事，允贤当面拒绝了徐侍郎，徐侍郎忿忿而去，杭纲亦是大怒。 王夫人慕允贤七白膏的美名前来讨要，谁知允贤非但说她不适合使用、而且还指出她体含诸多病症，王夫人讳疾忌医十分不快、忿忿离开。于夫人为允贤抗婚的事劝导了她，谁知徐夫人因为徐公子本不是她的亲子，并未因此而责怪允贤，相反热切地请她为自己看诊，并坚持要她写下了需要购买的药名。谁知徐夫人抓药服用后竟然一命呜呼，徐侍郎将允贤告上了顺天府。 程十三的侄子、刘平安的弟子程村霞从南京太医院归来，为了给他一个露脸的机会，程十三让他去庭上辅助庭审。 允贤被收监大牢，杭老夫人、于夫人前去狱中探望允贤。

第5集

　　在徐侍郎的安排下，允贤被换到了条件极差的牢房，周围尽是病人。允贤见不得狱友受苦，热心为她们诊治，却苦于狱卒刁难，没办法配药。送牢饭的罗大娘原是个医婆，她被允贤的侠义心肠所动，便教她救人，又传授了许多民间治病救人的奇特偏方，让允贤获益匪浅。她还提醒说，徐夫人可能服用过其他药理冲突的药草，这才身亡。案子开审时，允贤质疑徐夫人私自服用过其他药物，矛头直指太医院隶下的惠民药局。被软禁的祁钰得知允贤陷入官非却无力营救，十分着急，让吴太妃设法救助允贤，吴贤妃派人拿银子贿赂出庭作证的程村霞，遭到拒绝。原本程村霞要听从叔叔程十三的安排维护惠民药局的声誉，就更加以为允贤品性不端。程十三怕徐夫人之死一事连累到自己的名誉，让程村霞一定要把责任都推到允贤身上。

第6集

　　徐大人出钱让人作伪证，形势对允贤十分不利。紫苏赶去城隍庙想为主子烧头香祈福，半路上撞见醉醺醺的郑齐，他听说允贤入狱，非常紧张。开庭再审时，徐家婢女不承认徐夫人没有说清楚病症，其他当事人又不肯出庭作证，幸好有王夫人出面力证允贤的清白，可依然难逃被判罪的命运。庭上，王振突然到来，帮允贤讨还公道，她终于被无罪释放。杭纲为女儿和东厂扯上关系而急躁，幸有于夫人开解。另一边，刘平安指责程村霞出庭作证时不负责任的说辞，认为他失了医德。太后亦十分不满意皇帝纵容王振干涉判案的作为。允贤始终放不下徐夫人的死，又惊闻罗大娘被徐侍郎迁怒踹死，不禁伤心至极。想到自己行医不但带来了牢狱之灾，还间接害死人，允贤萌生了放弃医学的念头。祁钰巧妙施计，让汪美麟将有特殊意义的饰品带入宫中，皇后看到后连忙告诉英宗。